在处理劳动纠纷时，如果员工拒绝签署合同，雇主可能会面临一系列的问题和挑战。以下是一些可能的应对策略，以及相应的法律分析和案例研究：

1. 了解原因

首先，雇主应该尝试理解为什么员工会拒绝签署合同。这可能是因为合同条款对员工不利、有不明确之处或者与员工的期望不符。通过沟通找出问题的根源是解决问题的第一步。

2. 审查合同内容

确保劳动合同的内容合法合规，没有违反任何劳动法律法规。如果有不明确的条款或可能引起误解的地方，应尽快修改和完善。

3. 提供合理条件

如果员工因为某些特定条件而犹豫是否要签约，可以考虑提供更具吸引力的薪酬福利待遇或其他工作条件，以增加合同的吸引力。

4. 寻求第三方调解

如果直接谈判无法解决问题，可以考虑寻求第三方的帮助，如劳动仲裁机构或律师进行调解。他们可以帮助双方更好地理解和解决彼此之间的分歧。

5. 遵守法律规定

在任何情况下，雇主都必须严格遵守劳动法的规定，包括但不限于最低工资标准、加班费支付、社会保险缴纳等。否则，即使员工最初拒绝了合同，他们也可能会在后续的法律诉讼中占据优势地位。

6. 准备应急预案

如果员工仍然坚持拒绝签署合同，且无法达成一致意见，雇主需要做好最坏的打算，即终止雇佣关系。但在此之前，应当充分考虑解雇员工的后果，并采取适当的措施减少损失。

相关法律条文分析（以下内容基于中国大陆地区法律）：

根据《中华人民共和国劳动合同法》第十条规定：“建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。”这意味着，如果员工拒绝签署合同，则可能导致劳动关系的不确定性。此外，该法第八十二条规定：“用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。”因此，及时签订劳动合同对于保护双方的权益至关重要。

相关案例研究：

案例一：

在某公司诉张某劳动争议案中，张某入职后一直拒绝签署劳动合同，该公司多次催促无果后，最终决定解除与张某的劳动关系。然而，法院判决该公司需支付给张某因未签劳动合同期间的双倍工资补偿。这是因为即便员工拒绝签字，作为雇主仍负有主动签订书面劳动合同的义务。

案例二：

在李某诉某科技公司一案中，李某在试用期内拒绝签署公司的正式劳动合同，理由是他认为合同中的部分条款不合理。经过协商，公司同意调整这些条款并在法庭外达成了和解协议。这个案例表明，通过协商和灵活性，双方可以在一定程度上解决分歧。

综上所述，面对员工拒绝签署合同的情况，雇主应当采取积极的态度，通过沟通、谈判等方式寻找解决方案。同时，遵守劳动法的相关规定是底线，以确保双方的合法权益得到保障。